Švenčionių rajonas

• Samanykštis, ežeras (Labanoro seniūnija)
• Samanis, ežeras (Labanoro seniūnija)
• Samanis, ežeras (Švenčionių seniūnija)
• Saria, upė (Žeimena)
• Sarių tvenkinys (Žeimena)

• Sarių ežeras (Žeimena)
• Seklinas, ežeras (Ž-4)
• Sekluotis, ežeras (Žeimena)
• Sėtikis, ežeras (Švenčionių seniūnija)
• Siaurys, ežeras (Švenčionėlių seniūnija)

• Sirgėla, upė (Žeimena)
• Sirgėlis, ežeras (Švenčionėlių seniūnija)
• Sirvėta, upė (Kančiogino ež. (Kančioginos))
• Sirvėtas, ežeras (Švenčionių seniūnija)
• Skeimis, ežeras (Pabradės seniūnija)

• Skerdiksna, upė (Žeimena)
• Skerdžius, ežeras (Strūnaičio seniūnija)
• Sklinka, ežeras (Žeimena)
• Skreidragalė, ežeras (Pabradės seniūnija)
• Snieginis, ežeras (Švenčionėlių seniūnija)

• Staškinės ežeras (Kančiogino ež. (Kančiogina))
• Sudota, ežeras (Sarių seniūnija)
• Sudotėlis, ežeras (Sarių seniūnija)
• Svyla, upė (Birvėta)
• Svirneliai, ežeras (Ž-4)

• Šalnaitis, ežeras (Švenčionėlių seniūnija)
• Šaminė, upė (Šventelė – Dėmė)
• Šaminėlis, ežeras (Švenčionėlių seniūnija)
• Šaminis, ežeras (Švenčionėlių seniūnija)
• Šaukščiukas, ežeras (Rašios ež. (Rašelės))

• Vilniaus m. sav.
• Elektrėnų sav.
• Vilniaus r. sav.
• Ukmergės r. sav.
• Trakų r. sav.
• Šalčininkų r. sav.
• Širvintų r. sav.